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BMRB등록에는, 크게 다음과 같은 작업을 합니다.
- NMR데이타 파일의 작성 (Step2)
- 등록 웹 사이트 "ADIT-NMR" 을 이용하여, 연구한 분자에 대한 기술과 실험, 논문 등의 연구정보를 입력
다음, PDB 등록에는
- 원자 좌표 파일 또는 제한정보 파일의 작성.
- "ADIT-NMR" 에 의한 구조결정에 대한 정보입력
을 합니다.
연구한 분자의 기본적인 기술과 실험에 관한 정보 등, ADIT-NMR을 이용할 때 실험노트를 같이 준비하고 있으면 원활한 데이타의 입력이 가능합니다.
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BMRB에는, 귀속한 chemical shift와 같은 NMR데이타는 등록자 여러분께서, BMRB 규정서식 (NMR-STAR)로 기술하신 것을 텍스트 파일로 제공하시길 부탁드립니다. 기술방법에 대해서는 chemical shift 파일 작성 방법을 참조해 주십시요.
PDB 등록에 필요한 원자 좌표 파일의 데이타 형식에 대해선, 여기를 참조해 주십시요. 제한 정보 파일와 계산에 사용했던 형식대로의 제공할 수 있습니다.
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"ADIT-NMR" 을 이용해서, Step1에서 준비한 정보를 입력하고, Step2에서 작성한 NMR 데이타파일, 원자좌표, 제한정보 파일을 등록서버에 송신해 주세요.
ADIT-NMR의 입력내용의 설명에 대해서는 다음의 페이지를 참조해 주세요.
상기의 작업을 완료하면 화면위에 있는 "Deposit to BMRB" 또는 "Deposit to PDB" 버튼을 눌러서, 입력 데이타는 BMRB 또는 PDB에 제출합니다.
BMRB와 PDB데이타와 시간의 차를 두고 제출하는 것이 가능합니다.
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BMRB 또는 PDB의 등록번호는 ADIT-NMR에 따라서 자동적으로 발행됩니다. 각각의 ID가 적혀진 통지메일은 등록데이타의 제출 후 잠시 후에 등록자에게 도착합니다.
- BMRB의 등록번호
5자리의 숫자
- PDB의 등록ID
4문자의 알파벳과 숫자, 또는
"rcsbXXXXXX" 의 문자열 ("XXXXXX"와 6자리의 숫자)
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***** 등록번호 통지 메일의 수신 *****
여기에서의 ID가, BMRB 또는 PDB의 정식 등록번호가 됩니다.
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데이타 기술의 적합성 확인, chemical shift의 값을 BMRB 통계치와 비교, 다른 데이타베이스의 관련 등록 데이타의 비교등 학술상 타당성의 확인을 합니다. 이 결과에 대해서, 각각 BMRB 또는 PDB의 BMRB 담당자로 부터 등록자에 확인 결과 메일을 송신합니다.
당신의 BMRB 등록이 등록 처리되고 있는지 여부는 다음의 페이지에서 확인할 수있습니다.
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***** 확인결과 메일의 수신 *****
보통, 등록 후 1주일 이내에 통지가 됩니다.
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등록 데이타는, 확인 결과 메일 속에 기재되어있는 URL(등록데이타 확인용 웹브라우저)에서 열람가능합니다.BMRB 또는 PDB 부터의 통지와 등록 데이타의 내용을 등록자 쪽에서 확인해 주십시요. 질문 또는 데이타의 수정등이 있을 경우는 각각 담당자에 7일 이내에 반송해 주십시요. |
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*** 반송메일의 수신 ***
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등록자로부터 반송 메일의 내용을 등록 데이타에 반영하여, 최종 처리를 한 후에 등록 데이타를 공개유보의 상태로 합니다.
당신의 BMRB 등록이 공개유보되고 있는지 여부는 다음의 페이지에서 확인할 수있습니다.
등록자와 유보중에 등록데이타를 확인용 브라우저에서 언제고 열람가능합니다. 데이타의 추가, 수정이 필요할 경우, 연락하시면 수시 갱신이 가능합니다.
BMRB 또는 PDB의 스탭은, 공개전에 문헌 정보를 확인해 갱신합니다.
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등록자가 ADIT-NMR에서 지정한 공개 조건을 만족한 날에 BMRB 또는 PDB 웹브라우저에 등록데이타를 공개합니다.
최근 1개월간에 신규 공개된 BMRB 등록는 다음의 페이지에서 확인할 수있습니다.
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지정한 공개일 이후에, 등록 데이타가 BMRB웹사이트에 공개 되어 있는지를 확인합니다.
무엇인가 불분명한 점과 질문이 있을 경우에는 PDBj-BMRB 그룹에 연락해 주십시요. |
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