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HOME BMRBミラーサイト データ登録サイト 登録の手引き PDBj-BMRBについて

PDBj-BMRB Website

BMRBは、Wisconsin大学MadisonのBioMagResBankによって運営される、生体高分子のNMRデータのデータベースです。当ウェブサイトは、日本やアジアの研究者が、よりBMRBを利用しやすくなるよう設立されたウェブサイトで、日本蛋白質構造データバンク(PDBj)によって運営されています。

BMRB Database
BMRBミラーサイト

BMRBウェブサービスの利用はこちらからどうぞ。

Data Deposition
ADIT-NMR

データ登録はこちらからどうぞ。

BMRB登録とPDB登録が一緒に行うことができるようになりました。

現在、PDBADITではNMR構造解析による原子座標データの登録を受け付けておりませんので、登録の際はADIT-NMRを利用してください。

なお、2008.2.1よりNMR構造データのPDB登録は“Constraints File (制限情報ファイル)”の提供が必須となりました。

23残基以下のペプチドや3塩基以下の核酸、3つ以下の糖から成る生体高分子のNMR構造データの登録は、SMSDepをご利用ください。この構造データはBMRB登録となります。

登録マニュアル

BMRBへのデータ登録方法、その他登録に関わる資料は、ここを参照ください。

固体NMR用化学シフト帰属プログラム

固体NMRによる化学シフト帰属プログラムの一つとして、SAS_CNS (Simulated-Annealing Spectrum fitting with CNS) を公開しました。このプログラムは、ペプチドやタンパク質を対象とした固体NMRの実測スペクトルを入力することで自動的に主鎖骨格Cα,Cβ,C'化学シフトの帰属を行い、最適化された擬似NMRスペクトルと三次元原子座標を出力するシミュレーションプログラムです。

詳細およびダウンロードはこちらのページへ


お知らせ

*** 2009.6.1 ***
蛋白質のNMR構造評価のためのウェブサービスが以下のサイトで開始されました。
"Protein Structure Validation Suite (PSVS)"
"CING package"

*** 2008.9.16 ***
PDBフォーマットガイド バージョン3.2が公開されました (詳細...)

お知らせ一覧

配布資料

BMRBの利用に関する印刷用の配布資料です。

利用統計

PDBj-BMRBの利用に関する統計です。

更新履歴

*** 2009.03.31 ***
利用統計を更新

*** 2008.10.24 ***
登録の手引きに登録処理の進捗確認サイトへのリンク追加

更新履歴の一覧


関連サイト

協力機関

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Last Modified: January 21st, 2010 JST

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